Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO2P25791 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO2P25791 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO2P25791 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO2P25791 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms