Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms