Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNA1P20827 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNA1P20827 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms