Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms