Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms