Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCFC2P16383 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms