Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms