Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRAFP15056 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms