Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms