Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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