Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

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Length 811 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF839A8K0R7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF839A8K0R7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF839A8K0R7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF839A8K0R7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF839A8K0R7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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