Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms