Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms