Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD3A2A2Y4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms