Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms