Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms