Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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