Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms