Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms