Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNPPD1Q9BV87 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms