Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms