Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms