Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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