Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms