Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYRIPQ8NFW9 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms