Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LRRC17Q8N6Y2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRRC17Q8N6Y2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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