Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms