Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms