Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms