Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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