Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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