Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms