Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms