Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms