Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A12Q504Y0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms