Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms