Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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