Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms