Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FXNQ16595 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FXNQ16595 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms