Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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