Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RFTN1Q14699 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RFTN1Q14699 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RFTN1Q14699 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RFTN1Q14699 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RFTN1Q14699 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RFTN1Q14699 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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