Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms