Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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