Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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