Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms