Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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