Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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