Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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