Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms