Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms